מוטות מגנטיים משמשים בעיקר לסינון סיכות ברזל בחומרי גלם;לסנן כל מיני אבקות ונוזל עדינות, זיהומי ברזל בחצי נוזלי וחומרים מגנטיים אחרים.כיום, הוא נמצא בשימוש נרחב בתעשייה הכימית, מזון, מיחזור פסולת, פחמן שחור ותחומים אחרים.